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第八屆圖書館論壇 校體購2

Spartan’18 Parallel Suite是Wavefunction的最新版本

教育裝備采購網(wǎng) 2020-03-02 11:05 圍觀1956次

Spartan’18 Parallel Suite是Wavefunction的最新版本

  Spartan’18 Parallel Suite是Wavefunction的最新版本,Spartan系列分子建模軟件用于研究和教育,意味著獲得教育的機會大大改善現(xiàn)代計算方法,同時開發(fā)新的界面增添了Spartan的用戶友好性。 在最新版本中,特別注意了柔韌性的特性分子和NMR光譜。 新增和改進的功能包括:

  自動構象分析

  獲取準確的玻爾茲曼分布的多步驟配方已實施。 結合MMFF,Hartree-Fock和密度

  功能模型,最終獲得玻爾茲曼分布從B97M-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311G *]能量中使用B3LYP /6-31G *幾何形狀或wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311G *]能量帶有wB97X-D / 6-31G *幾何形狀。 用戶自定義可用于用于獲得幾何形狀和能量的理論模型。

  柔性分子的自動NMR

  自動化構象分析以及NMR化學位移根據(jù)經(jīng)驗校正的B3LYP / 6-31G *或wB97X-D / 6-31G *計算模型提供了柔性分子的Boltzmann平均NMR光譜。

  DP4支持

  可以使用DP4測量確定最匹配的計算和實驗NMR化學位移從在各種立體聲/區(qū)域異構體(或玻爾茲曼每個異構體的平均NMR)使用B3LYP / 6-31G *或wB97X-D / 6-31G *型號。

Spartan’18 Parallel Suite是Wavefunction的最新版本

  耦合常數(shù)

  二鍵,三鍵,四鍵和更高鍵的HH,CH和CC耦合常數(shù)可以完全計算,也可以僅使用費米接觸項來計算。 CH耦合常數(shù)允許計算逼真的2D HMBC圖。對于向后兼容性,來自一個三鍵HH耦合常數(shù)Karplus方程的擴展形式仍然可用??蛇M行3D到2D的結構轉換,并且可能會生成2D草圖復制/粘貼到光譜和曲線圖中。獲取準確的玻爾茲曼分布的多步驟配方。

  已實施。結合MMFF,Hartree-Fock和密度功能模型,最終獲得玻爾茲曼分布從B97M-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311G *]能量中使用B3LYP /6-31G *幾何形狀或wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311G *]能量帶有wB97X-D / 6-31G *幾何形狀。用戶自定義可用于獲得幾何形狀和能量的理論模型。自動構象分析柔性分子的自動NMRDP4支持耦合常數(shù)

  3D結構中的2D草圖

  可進行3D到2D的結構轉換,并且可能會生成2D草圖復制/粘貼到光譜和曲線圖中。

  現(xiàn)代計算方法

  Spartan’18并行套件可方便地訪問許多重要的計算方法,著重于密度泛函其中的模型:

  • GGA功能: B86PW91,BLYP,BPW91,B97-D2,SOGGA11,PBE-D3,VV10

  • GH-GGA功能:B3LYP,B3LYP-D3,EDF2,B3PW91,B97-3,MPW3LYP,SOGGA11-X

  • RSH-GGA功能:wB97X-D,wB97X-V,wB97X,CAM-B3LYP,N12-SX,LC-VV10

  • mGGA功能:B97M-V,M06-L,BMK,M11-L,TPSS-D3

  • GH-mGGA功能:M06-2X,M06,M08-HX,M08-SO,MPW1B95

  • RSH-mGGA功能:M11,wB97M-V,MN12-SX在基于波動函數(shù)的模型或相關模型中,有QCISD,QCISD(T),CCSD和CCSD(T)以及G3的電氣組件,G3(MP2),G4和G4(MP2)。

  可用的基礎集包括廣泛使用的Pople集的全部范圍催款相關一致集和Ahlrich / Weigend def2集。三重ζ基集現(xiàn)在可用于過渡金屬和鑭系元素,改進了反應能量的計算。對偶基集近似可用于雙ζ和更大的基集,導致計算時間減少一個數(shù)量級。

  從菜單:

  Pople:STO-3G,3-21G,6-31G *,6-31G **,6-31 + G **,6-311G **,6-311 + G **,

  6-311G(2d,p),6-311 + G(2d,p),6-311 + G(2df,2p),6-311 + G(3df,2p);

  基本6-31G和6-311G基礎集的其他變化可能

  被指定

  催款:cc-pVDZ,aug-cc-pVDZ,cc-pVTZ,aug-cc-pVTZ,cc-pVQZ,八月-cc-pVQZ

  Ahlrichs / Weigend:def2-SV(P),def2-SVPD,def2-TZVP,def2-TZVPPD,def2-QZVP,def2-QZVPPD

  遠程提交

  Spartan’18 Parallel Suite可以用作遠程的服務器提交的計算結果以及Spartan光譜和屬性數(shù)據(jù)庫,從遠程設備擴展對計算工具的訪問。遠程可以從運行Spartan’14或更高版本的計算機上進行計算以及運行iSpartan應用的iOS設備(iPad和iPhone)。

  SPARTAN’18并行套件功能集

  圖形界面

  以2D方式自動繪制有機,無機,有機金屬分子轉換為3D結構。提供組,環(huán)和配體模板,構建有機,無機和有機金屬分子,肽和核苷酸,3D取代分子自動將3D結構轉換為2D草圖

  無縫鏈接到ChemDraw?顯示/查詢各種分子模型樣式顯示偶極子向量,氫鍵,點和平面顯示和自定義化學功能描述符顯示用戶定義的注釋使用結構,化學功能描述符或原子標記對齊分子。

  使分子與藥效團對齊使用反應箭頭建立過渡狀態(tài)從廣泛的反應庫生成過渡態(tài)生成并顯示分子軌道,電子密度,自旋密度靜電勢,靜電勢圖,軌道圖和局部電離勢圖可選的輪廓網(wǎng)格和透明表面,以改善可視化即時生成和顯示軌道能圖(可選)以紅色,白色,藍色色標查看屬性映射。

  在屬性映射的默認屬性范圍和絕對屬性范圍之間切換根據(jù)封閉電子的百分比顯示電子密度突出顯示表面和特性圖上溶劑可及的區(qū)域顯示R / S手性標記,反轉手性中心和絕對手性集成反應能量計算器整理電子表格中的數(shù)據(jù)將計算的光譜表打印并保存為PDF文件執(zhí)行回歸分析并制作,保存和打印2D或3D圖在Spartan文件中嵌入外部文件,例如MS?Office和Adobe?PDF文件繪制,打印和保存計算出的和實驗的紅外,拉曼和紫外/可見光譜顯示計算的1D(質子,13C,DEPT)和2D(COSY,HSQC,HMBC)和實驗一維質子和13C NMR光譜用計算結果覆蓋實驗HMBC和COZY 2D NMR光譜。

  任務

  計算應變能、總能和生成熱確定氣相平衡和過渡狀態(tài)幾何形狀,測定溶劑存在時的幾何形狀和紅外光譜,確定全球最低;計算玻爾茲曼權值得到構象異構體的能量分布建立不同的構象庫,用于相似性分析,根據(jù)結構或化學功能進行相似性分析掃描幾何坐標,生成反應序列計算反應和活化能、計算紅外光譜、拉曼光譜、紫外/可見光譜和核磁共振光譜,確定柔性分子的核磁共振波譜,匹配計算和實驗核磁共振波譜,搜索SSPD和NIST實驗數(shù)據(jù)庫以匹配計算出的紅外光譜,挖掘計算出的分子、原子和反應性質的數(shù)據(jù)庫。

  計算方法

  分子力學。SYBYL、MMFF94 MMFF (aq)半經(jīng)驗。MNDO, AM1, RM1, PM3(過渡金屬參數(shù)),PM6 Hartree-Fock分子軌道理論。

  密度泛函理論(菜單功能):

  • GGA泛函:B86PW91、BLYP、BPW91、B97-D2、SOGGA11、PBE-D3、VV10

  • GH-GGA泛函:B3LYP, B3LYP- d3, EDF2, B3PW91, B97-3, SOGGA11-X

  • RSH-GGA泛函:wB97X- d, wB97X- v, wB97X, CAM-B3LYP, N12-SX, LC-VV10

  • mGGA功能:B97M-V, M06-L, BMK, M11-L, TPSS-D3

  • GH-mGGA函數(shù):M06- 2x, M06, M08-HX, M08-SO, MPW1B95

  • RSH-mGGA函數(shù):M11, wB97M-V, MN12-SX

  可以自定義函數(shù),也可以通過關鍵字指定其他函數(shù)M?ller Plesset。MP2, MP3, MP4和RI-MP2

  基于波函數(shù)的高級相關模型:

  • G3(MP2)elect, G3elect, G4(MP2)elect, G4elect, QCISD, QCISD(T), CCSD, CCSD(T)

  • 基于附加波函數(shù)的高級相關方法是可行的

  • 來自關鍵詞,包括CCSD, CCSD(T), OD, OD(T), QCCD, VOD, VQCCD

  • 激發(fā)態(tài)的方法。CIS, CIS(D), RI-CIS(D), QCIS(D), QCISD(T), TDDFT

  • 可用于CIS、CIS(D)和TDDFT的梯度

  • 熱化學配方。T1, G3(MP2), G3, G4(MP2), G4

  基本集(可從菜單中獲得):

  • Pople: STO-3G, 3-21G, 6-31G*, 6-31G**, 6-31+G**, 6-311G**, 6-311+G**,6-311G(2d,p), 6-311+G(2d,p), 6-311+G(2df,2p), 6-311+G(3df,2p);additional variations on the underlying 6-31G and 6-311G basis sets maybe specified

  • Dunning: cc-pVDZ, aug-cc-pVDZ, cc-pVTZ, aug-cc-pVTZ, cc-pVQZ,aug-cc-pVQZ

  • Ahlrichs/Weigend: def2-SV(P), def2-SVPD, def2-TZVP, def2-TZVPPD,def2-QZVP, def2-QZVPPD

  對>Kr元素(包括鑭系元素和稀土元素)的贗勢的自動使用選擇錒系元素)

  雙重基底集合近似可用double-ζ和較大的基礎設置進口海關基準集

  屬性和QSAR描述符

  Mulliken,自然和靜電適應電荷偶極和更高的矩,極化率和超極化率焓,熵和自由能C-PCM以及SM5.4,SM8,SM12,SMD和SS(V)PE的溶劑化能量統(tǒng)計工具,用于比較計算出的13 C NMR和實驗13 C NMR位移HOMO,LUMO和SOMO能量基于空間填充模型的面積,極地表面積和體積基于電子密度的面積,可及區(qū)域,極性區(qū)域和體積最小/最大靜電勢和最小電離勢構象異構體和互變異構體數(shù)目氫鍵受體和供體的數(shù)量。

  規(guī)格

  NMR,IR,拉曼光譜和UV /可見光譜可使用多種計算方法理論模型:用于NMR的Hartree-Fock和密度泛函模型,半經(jīng)驗,Hartree-Fock,密度函數(shù)和MP2模型,用于IR,Hartree-Fock,拉曼和紫外線/可見光的密度函數(shù)模型。

  附加功能

  Hartree-Fock、密度泛函、RI-MP2和熱化學配方。分子群的自動處理分子對稱性的自動使用

  從“文件”菜單查看最近的文檔使用約束和/或凍結原子進行優(yōu)化構象搜索的NOEs識別互變異構體并生成互變異構體列表進口實驗紅外、拉曼和核磁共振光譜導入InChI、SMILES、CDX、CIF、SKC、SDF、TGF、XYZ、Macromodel、PDB中的結構,SYBYL MOL和MOL2格式從劍橋結構數(shù)據(jù)庫和蛋白質數(shù)據(jù)庫中檢索結構,從蛋白質中提取配體和結合位點(PDB文件)。

  數(shù)據(jù)庫

  Spartan光譜和屬性數(shù)據(jù)庫(SSPD)?包含兩個集合,從EDF2 / 6-31G *模型獲得的約300,000個有機分子中的第一個≈300,000個有機分子和≈2,000個有機金屬分子中的第二個

  從wB97X-D / 6-31G *模型獲得。 兩者都包含優(yōu)化的幾何體,能量和分子特性的選擇,波動函數(shù)(允許動態(tài)生成圖形表面)和NMR光譜。 紅外線還為EDF2 / 6-31G *集合中的分子提供了光譜。 個人SSPD條目可以替換用戶構建的結構,并且兩個集合都是可搜索的按子結構,名稱,分子式和異構體分類。

  Spartan Reaction Database(SRD)?包含約1,800個反應的過渡態(tài)可通過任意2D的子結構和“反應箭頭”的組合進行搜索草圖或3D模型。

  w B97X-V / 6-311 + G(2df,2p)能源數(shù)據(jù)庫

  SSPD條目現(xiàn)在包括從wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)計算出的能量模型,提供比

  wB97X-D / 6-31G *型號。

  增強的并行性能

  并行化現(xiàn)在包括共享內(nèi)存頻率計算。 性能已針對> 8個核心系統(tǒng)進行了改進。

  摘要輸出

  提供了有關NMR化學位移和偶聯(lián)常數(shù),IR和拉曼的表格頻率和強度以及紫外線/可見光吸收頻率和強度提供并且可以另存為PDF文件。

  化學轉換標簽

  實驗NMR化學位移的標簽和計算值之間的差異(Boltzmann平均)和實驗化學位移現(xiàn)在可用。

  最低系統(tǒng)要求

  WINDOWS

  ? Intel or AMD only

  ? Windows 7, 8.1, or 10 **

  ? 128 GB disk space or higher

  (SSD recommended)

  ? 4 GB of RAM (at least 2GB RAM per core)

  MACINTOSH

  ? Intel-based Macintosh only

  ? OS X 10.11, 10.12, 10.13 or 10.14

  ? 128 GB disk space or higher

  (SSD recommended)

  ? 4 GB RAM (at least 2GB of RAM per core)

  * Spartan’18并行套件可用于Windows,Macintosh和Linux。 Spartan’18可用僅適用于Windows和Macintosh。 有關Linux系統(tǒng)要求,請聯(lián)系Wavefunction。

  **完全支持Windows 7、8和10觸摸屏計算機和平板電腦。

點擊進入北京環(huán)中睿馳科技有限公司展臺查看更多 來源:教育裝備采購網(wǎng) 作者:北京環(huán)中睿馳科技有限公司 責任編輯:陽光 我要投稿
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