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第八屆圖書館論壇 校體購(gòu)2

遇見容器HPC 蘭州大學(xué)的高性能計(jì)算應(yīng)用之路

教育裝備采購(gòu)網(wǎng) 2020-08-25 15:04 圍觀2340次

  “當(dāng)今,科學(xué)研究可分為三種:實(shí)驗(yàn)、理論和計(jì)算。”

  ——諾貝爾獎(jiǎng)得主,威爾遜

  如果說(shuō),在科學(xué)的發(fā)展長(zhǎng)河中,伽利略和牛頓奠定了實(shí)驗(yàn)科學(xué)和理論科學(xué)的基石。那么,計(jì)算機(jī)的發(fā)明,則把計(jì)算推上了人類科學(xué)活動(dòng)的另一個(gè)前沿,此后,計(jì)算在科學(xué)活動(dòng)中發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。

  例如,被稱為“ 上帝粒子”的希格斯(Higgs)玻色子是2012年度最大的科學(xué)突破。它的發(fā)現(xiàn)和捕捉之路離不開歐洲核子研究中心(CERN),而對(duì)撞實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目則離不開背后的大規(guī)模數(shù)據(jù)處理,大量的數(shù)據(jù)處理則需要依靠高性能計(jì)算(HPC)。

  不僅如此,近年來(lái),計(jì)算在生命科學(xué)、天文物理學(xué)、醫(yī)學(xué)、系統(tǒng)科學(xué)等各種科學(xué)中,所發(fā)揮的作用日益增大。并且,在氣象、核技術(shù)、石油勘探、航空航天、裝備制造研發(fā)、運(yùn)輸交通等國(guó)民與國(guó)防建設(shè)的很多重要領(lǐng)域中,計(jì)算成了必不可少的手段。

  “互聯(lián)網(wǎng)的應(yīng)用有兩大驅(qū)動(dòng)力,一個(gè)是商業(yè)的互聯(lián)網(wǎng),另一個(gè)就是科研領(lǐng)域,1994年中國(guó)接入互聯(lián)網(wǎng)之后,接入的第一個(gè)科研應(yīng)用就是高能物理?!碧m州大學(xué)網(wǎng)絡(luò)安全與信息化辦公室主任陳文波主任在接受采訪時(shí)說(shuō)。

蘭州大學(xué)的HPC之“難”

  蘭州大學(xué)是教育部直屬的全國(guó)重點(diǎn)綜合性大學(xué),是國(guó)家“985工程”和“211工程”重點(diǎn)建設(shè)高校之一,于2017年入選教育部世界一流大學(xué)建設(shè)名單,并且有4個(gè)學(xué)科入選世界一流學(xué)科建設(shè)名單。

  據(jù)了解,高性能計(jì)算作為蘭州大學(xué)的科研工具扮演了極其重要的角色,“我們平臺(tái)的超算能力是1200萬(wàn)億,在西部高校的HPC規(guī)模應(yīng)該是最大的?!?蘭州大學(xué)網(wǎng)絡(luò)安全與信息化辦公室主任、超算中心主任陳文波主任說(shuō)。

  學(xué)校先后在物理、化學(xué)、大氣學(xué)院等學(xué)院建設(shè)了高性能計(jì)算中心,給各學(xué)院的教師和學(xué)生提供了科研支撐。“在上世紀(jì)80年代,全國(guó)開始建立計(jì)算中心,蘭大就是其中之一,當(dāng)時(shí)用的是日本富士通的機(jī)器,之后,又從中小型機(jī)過(guò)渡到X86服務(wù)器,2004、2015年開始采用計(jì)算集群,到了2010年后,各學(xué)院開始了自建…….”陳主任回顧了蘭州大學(xué)的HPC應(yīng)用之路。

  目前,雖然各學(xué)院分散建設(shè)高性能計(jì)算中心的模式在一定程度上滿足了現(xiàn)有的科研需求,但也存在著諸多問(wèn)題,難以滿足學(xué)校長(zhǎng)遠(yuǎn)的發(fā)展。主要表現(xiàn)在:

  1、資源浪費(fèi):各學(xué)院獨(dú)立建設(shè)高性能計(jì)算集群,物理設(shè)備或部門之間的隔離導(dǎo)致資源無(wú)法共享,造成資源嚴(yán)重浪費(fèi);

  2、運(yùn)維管理復(fù)雜:各學(xué)院老師需要承擔(dān)各院高性能計(jì)算集群設(shè)備的運(yùn)維管理工作,無(wú)法更好地聚焦科學(xué)研究;

  3、采購(gòu)成本高:由于高性能計(jì)算集群建設(shè)沒(méi)有做到全校一盤棋統(tǒng)籌,導(dǎo)致高性能計(jì)算相關(guān)的設(shè)備采購(gòu)成本及運(yùn)營(yíng)成本居高不下;

  4、用戶體驗(yàn)差:由于大多數(shù)有科學(xué)計(jì)算需求的師生都是非計(jì)算機(jī)專業(yè)出身,存在對(duì)超算系統(tǒng)概念不了解、環(huán)境不熟悉、使用門檻高的問(wèn)題。對(duì)于一名通常只有2~3年研究時(shí)間的學(xué)生來(lái)說(shuō),基礎(chǔ)配置和調(diào)試等工作占用了大量的研究時(shí)間;

  5、不利于交叉學(xué)科發(fā)展:學(xué)科交叉點(diǎn)是科學(xué)新的生長(zhǎng)點(diǎn)、新的科學(xué)前沿,而校級(jí)平臺(tái)是學(xué)科交叉的溫床,但各院獨(dú)立建設(shè)的現(xiàn)狀無(wú)法滿足高性能計(jì)算中交叉學(xué)科的發(fā)展需求;

  面對(duì)以上的種種問(wèn)題,蘭州大學(xué)亟需統(tǒng)籌規(guī)劃全校的高性能計(jì)算中心建設(shè),構(gòu)建全校統(tǒng)一的高性能計(jì)算公共服務(wù)平臺(tái)。但是統(tǒng)一建設(shè)仍面臨著很多新的挑戰(zhàn),例如,如何實(shí)現(xiàn)計(jì)算資源的靈活調(diào)度?如何實(shí)現(xiàn)用戶的業(yè)務(wù)隔離?如何實(shí)現(xiàn)作業(yè)的合理調(diào)度?

遇見容器HPC

  據(jù)蘭州大學(xué)網(wǎng)絡(luò)安全與信息化辦公室超算中心高級(jí)工程師 張洋老師回憶,早在五六年前,在蘭州大學(xué)跟美國(guó)圣地亞哥超算中心合作項(xiàng)目的時(shí)候,開始對(duì)容器HPC有初步的了解并持續(xù)關(guān)注。所以在規(guī)劃建立統(tǒng)一的高性能計(jì)算平臺(tái)的時(shí)候,優(yōu)先考慮使用容器HPC。據(jù)悉,針對(duì)蘭州大學(xué)在統(tǒng)一高性能計(jì)算平臺(tái)的建設(shè)過(guò)程中面臨的問(wèn)題,華為利用自身大量的行業(yè)數(shù)字化轉(zhuǎn)型經(jīng)驗(yàn)和生態(tài)伙伴的整合能力,攜手聯(lián)科提供的基于容器的HPC解決方案在眾多競(jìng)標(biāo)者中脫穎而出。

  據(jù)了解,此方案運(yùn)用云計(jì)算技術(shù)、前端展示以及移動(dòng)計(jì)算等技術(shù),打破了傳統(tǒng)校園計(jì)算中心的建設(shè)模式,通過(guò)容器的隔離和鏡像打包功能,將平臺(tái)管理員從復(fù)雜的管理工作中解放出來(lái),建立基于容器技術(shù)的高效公共計(jì)算云平臺(tái)的管理模式和應(yīng)用服務(wù)體系,讓用戶像使用手機(jī)一樣,方便的使用高性能計(jì)算,通過(guò)移動(dòng)設(shè)備隨時(shí)隨地的提交任務(wù),查看結(jié)果。終,通過(guò)容器解決方案,做到計(jì)算環(huán)境快速部署和切換。

  “早期做方案調(diào)研的時(shí)候,我們找了五個(gè)學(xué)院的應(yīng)用進(jìn)行測(cè)試,觀察其性能的損耗,因?yàn)閷?duì)HPC應(yīng)用來(lái)說(shuō),性能是優(yōu)先需要考慮的,結(jié)果是,經(jīng)過(guò)測(cè)試后,容器確實(shí)性能損耗和物理機(jī)相比基本上沒(méi)有多大的區(qū)別,并且,多節(jié)點(diǎn)的MPI應(yīng)用也都能跑起來(lái)?!睆埨蠋熣f(shuō)。

  具體來(lái)說(shuō),容器HPC解決方案統(tǒng)一部署之后,給蘭州大學(xué)帶來(lái)了顯而易見的價(jià)值:

  首先,簡(jiǎn)管理。建立統(tǒng)一的計(jì)算平臺(tái),通過(guò)用戶管理子系統(tǒng),對(duì)平臺(tái)使用者的身份進(jìn)行認(rèn)證、審批、權(quán)限控制、配額信息管理、用戶組及用戶成員關(guān)系等管理,幫助學(xué)校實(shí)現(xiàn)計(jì)算平臺(tái)的在各學(xué)院的租戶化管理、運(yùn)營(yíng);

  其次,降成本。通過(guò)容器隔離子系統(tǒng),在同一個(gè)計(jì)算平臺(tái)上同時(shí)運(yùn)行不同版本的操作系統(tǒng),擁有獨(dú)立的網(wǎng)絡(luò)配置(包括高速以太網(wǎng)以及高速IB計(jì)算網(wǎng)),并可訪問(wèn)不同的存儲(chǔ)空間及數(shù)據(jù)集。保證虛擬化的資源性能與物理性能損失小于1%,滿足科學(xué)與應(yīng)用數(shù)據(jù)中心高性能計(jì)算的需求;

  再次,均資源。通過(guò)任務(wù)調(diào)度子系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)從多種計(jì)算資源中選擇合適的節(jié)點(diǎn)啟動(dòng)容器。并通過(guò)資源監(jiān)控模塊、作業(yè)執(zhí)行監(jiān)控模塊以及作業(yè)調(diào)度算法模塊實(shí)現(xiàn)合理的作業(yè)調(diào)度,實(shí)現(xiàn)多個(gè)學(xué)院的用戶在平臺(tái)上能夠均衡地獲取到資源。

寫在最后

  教育科研水平直接代表著國(guó)家的科技實(shí)力與能力。在過(guò)去,我國(guó)在高性能計(jì)算的應(yīng)用方面,一直和歐美存在著差距,“如今,我國(guó)超算的發(fā)展是爆炸式的,我們已經(jīng)慢慢從學(xué)習(xí)的階段走向了應(yīng)用階段。”陳主任在采訪結(jié)束時(shí)表示。

  當(dāng)前,國(guó)內(nèi)高校HPC應(yīng)用迎來(lái)了一個(gè)黃金時(shí)代,而容器HPC將引領(lǐng)高校的超算發(fā)展,助力高??蒲械姆睒s之路。

來(lái)源:北國(guó)網(wǎng) 責(zé)任編輯:張肖 我要投稿
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