Discovery Studio2016輔助酶的理性設(shè)計(jì)
培訓(xùn) 時(shí)間：2016年3月28-30日，共三天
培訓(xùn)地點(diǎn)： 【蘇州】創(chuàng)騰科技培訓(xùn)中心
培訓(xùn) 內(nèi)容： 本次培訓(xùn)以Discovery Studio2016軟件的基礎(chǔ)操作和應(yīng)用為核心，以酶的理性設(shè)計(jì)為基礎(chǔ)，針對酶的理性設(shè)計(jì)中所涉及的技術(shù)進(jìn)行介紹與上機(jī)操作，包括：基于酶的一級序列預(yù)測翻譯后修飾位點(diǎn)和酶的三維結(jié)構(gòu)、酶-底物相互作用預(yù)測及優(yōu)化、通過虛擬氨基酸突變設(shè)計(jì)同底物親和力更高的酶或穩(wěn)定性更高的酶、預(yù)測并引入新的二硫鍵提高酶的穩(wěn)定性、預(yù)測酶結(jié)構(gòu)表面易聚集的位點(diǎn)并進(jìn)行突變優(yōu)化、采用常規(guī)動(dòng)力學(xué)及拉伸動(dòng)力學(xué)分析酶的構(gòu)象變化等等。
· 培訓(xùn)日程安排
| 日期 | 時(shí)間 | 內(nèi)容 |
| 第一天 | 08:30-09:00 | 報(bào)到和注冊 |
| 報(bào)到地點(diǎn)： 蘇州創(chuàng)騰培訓(xùn)中心 | ||
| 09:00-10:15 | Discovery Studio 基本界面 | |
| DS 背景介紹， DS 界面介紹，蛋白與小分子的預(yù)處理方法介紹與實(shí)際操作。 | ||
| 10:15-10:30 | 茶歇 | |
| 10:30-11:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)概述 | |
| 酶的理性設(shè)計(jì)專題之一：酶的序列分析 | ||
| 基于酶的一級序列預(yù)測其翻譯后修飾位點(diǎn)，應(yīng)用與操作。 | ||
| 酶的理性設(shè)計(jì)專題之二：酶結(jié)構(gòu)的構(gòu)建 | ||
| 同源建模核心原理介紹及案例分析，同源模板的選取技巧、同源模型的優(yōu)化與評價(jià)等。 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-15:00 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之二：酶結(jié)構(gòu)的構(gòu)建 | |
| 同源建模參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 15:00-15:15 | 茶歇 | |
| 15:15-16:30 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 (CDocker) | |
| 分子對接的核心與原理，酶催化位點(diǎn)的定義，酶 - 底物最終作用模式的選取與分析，關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的識別與顯示方法， CDOCKER 基本原理及案例分析。 | ||
| 16:30-17:15 | 課程討論及答疑 | |
| 第二天 | 09:00-10:15 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 (CDocker) |
| CDOCKER 參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 10:15-10:30 | 茶歇 | |
| 10:30-11:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 (FlexDock) | |
| 對接過程中蛋白分子柔性的考慮方法， Flexible Docking 基本原理介紹、案例分析； | ||
| 參數(shù)設(shè)置意義、 Flexible Docking 實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-15:00 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 ( 分子動(dòng)力學(xué)模擬 ) | |
| MD 基本原理，溶劑模型的添加，束縛條件的設(shè)定，平衡狀態(tài)的判定等 ; | ||
| MD 參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 15:00-15:15 | 茶歇 | |
| 15:15-16:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 ( 拉伸分子動(dòng)力學(xué)模擬) | |
| SMD 基本原理與應(yīng)用，外力的添加，力時(shí)間曲線的生成與分析， PMF 的計(jì)算與分析； | ||
| SMD 參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 16:45-17:15 | 課程討論及答疑 | |
| 第三天 | 09:00-10:00 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之三：酶與底物相互作用機(jī)理研究 (QMMM) |
| QMMM 基本原理介紹、參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析 | ||
| 10:00-10:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之四：基于親和力進(jìn)行酶設(shè)計(jì) | |
| 突變位點(diǎn)、突變組合的建議，原理介紹、參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析 | ||
| 10:45-11:00 | 茶歇 | |
| 11:00-11:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之四：基于熱穩(wěn)定性進(jìn)行酶設(shè)計(jì) | |
| 突變位點(diǎn)、突變組合的建議，原理介紹、參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-14:45 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之四：蛋白二硫鍵的預(yù)測與引入 | |
| 二硫鍵位點(diǎn)的選取方法，實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 | ||
| 酶的理性設(shè)計(jì)專題之四：基于蛋白聚集效應(yīng)進(jìn)行酶設(shè)計(jì) | ||
| 建議可能的突變位點(diǎn)降低酶的聚集，基本原理介紹、參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析 | ||
| 14:45-15:00 | 茶歇 | |
| 15:00-16:00 | 酶的理性設(shè)計(jì)專題之五：篩選酶的潛在底物 | |
| 篩選命中率提高的方法， Libdock 和 LigandFit 基本原理介紹、參數(shù)設(shè)置意義、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析 | ||
| 16:00-17:00 | 課程討論及答疑 |
· 培訓(xùn)費(fèi)用
| 注冊類型 |
培訓(xùn)費(fèi)用 (1 人參加) |
優(yōu)惠 價(jià)格及條件（符合任一條件即可） 優(yōu)惠條件（不可與其他優(yōu)惠條件同享）： 1 、3月21日前成功報(bào)名并匯款； 2、 同一單位，≥2人參加； 2 、 同一學(xué)員（2011年至今）曾參加過DS培訓(xùn)課程 |
| 教育科研客戶 | 3600/ 人 | 3000/ 人 |
| 政府科研/企業(yè)客戶 | 5400/ 人 | 4500/ 人 |
· 報(bào)名方式
報(bào)名請登入創(chuàng)騰科技網(wǎng)站：www.neotrident.com，歡迎感興趣的老師和同學(xué)踴躍報(bào)名。名額有限，報(bào)名從速!
· 關(guān)于蘇州創(chuàng)騰科技培訓(xùn)中心
2016新培訓(xùn)基地——蘇州培訓(xùn)中心正式運(yùn)營!
新的培訓(xùn)中心坐落在蘇州工業(yè)園區(qū)2.5產(chǎn)業(yè)園內(nèi)，這里地處蘇州工業(yè)園區(qū)中新大道與中環(huán)路東側(cè)，具有英倫古典學(xué)院風(fēng)的建筑群，提供包括銀行、郵政、中西餐廳、精品書屋、商業(yè) 零售、運(yùn)動(dòng)休閑等生活配套載體;目前已經(jīng)吸引包括IBM、百特醫(yī)療、TE在內(nèi)的多家世界名企落戶。
創(chuàng)騰科技(蘇州)培訓(xùn)中心配備了國際最先進(jìn)的研發(fā)信息化軟硬件資源，相信嶄新的學(xué)習(xí)環(huán)境、領(lǐng)先的軟硬件設(shè)施、以及濃郁的學(xué)習(xí)氛圍能給學(xué)員帶來愉快地學(xué)習(xí)體驗(yàn)。創(chuàng)騰科技的培訓(xùn)講師都具有多年相關(guān)領(lǐng)域研發(fā)與實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)，從理論到實(shí)踐，從初級到高級，從入門到精通，通過實(shí)例講解和上機(jī)操作結(jié)合的授課模式，來快速提升學(xué)員對信息化科研工具的理解和掌握。創(chuàng)騰科技將力求為學(xué)員提供最專業(yè)，最完善的培訓(xùn)服務(wù)!
希望蘇州培訓(xùn)基地的成立能為國內(nèi)相關(guān)的研發(fā)機(jī)構(gòu)輸出一大批優(yōu)秀的人才，加速我國研發(fā)信息化的步伐。
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