自2012年以來，研究人員常用一種叫做CRISPR的強(qiáng)大“基因組編輯”技術(shù)對生物的DNA序列進(jìn)行修剪、切斷、替換或添加。CRISPR來自微生物的免疫系統(tǒng)，這種工程編輯系統(tǒng)利用一種酶，能把一段作為引導(dǎo)工具的小RNA切入DNA，就能在此處切斷或做其他改變。
CRISPR已經(jīng)成為生命科學(xué)領(lǐng)域受關(guān)注的基因編輯技術(shù)，其效果得到大家一致認(rèn)可。雖然科學(xué)家可通過RT-PCR、WB等方法間接證明CRISPR的功能，但仍未有直接的證據(jù)來證實(shí)。究其原因：一是生物分子間的相互作用速率快，需要高速的成像手段才能捕捉到;二是生物分子比較小，通常為納米，普通顯微鏡由于受光學(xué)衍射限所限不能分辨。近，日本Kanazawa University的科學(xué)家利用 視頻原子力顯微鏡HS-AFM 成功觀察到了實(shí)時(shí)CRISPR基因編輯，為CRISPR技術(shù)的有效性提供了直接的證據(jù)。
HS-AFM視頻結(jié)果直觀顯示構(gòu)象差異：
HS-AFM視頻結(jié)果顯示apo-Cas9為柔性構(gòu)象(flexible conformations)，而Cas9–RNA則為穩(wěn)定的雙葉型構(gòu)象(stable bilobed architecture)。
Cas9-RNA介導(dǎo)的PAM依賴性DNA識別
Cas9-RNA靶向定位到目的DNA，形成Cas9–RNA–DNA復(fù)合體。
Cas9-RNA對目的DNA進(jìn)行剪切
在Mg2+存在的條件下，Cas9-RNA對目的DNA進(jìn)行特異性剪切。
這項(xiàng)工作的完成主要借助了日本RIBM公司研發(fā)的超高速視頻原子力顯微鏡HS-AFM，HS-AFM突破了傳統(tǒng)原子力顯微鏡“掃描成像速慢”的限制，能夠?qū)崿F(xiàn)在液體環(huán)境下超快速動態(tài)成像，分辨率為納米水平。待測樣品無需特殊固定，不影響生物分子的活性，尤其適用于生物大分子互作動態(tài)觀測。推出至今，全球已有80多位用戶，發(fā)表SCI論文200余篇，其中包括Science, Nature, Cell 等雜志。
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