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第八屆圖書館論壇 校體購(gòu)2

酵母基因組DNA提取試劑盒

教育裝備采購(gòu)網(wǎng) 2018-12-04 10:59 圍觀490次

酵母基因組DNA提取試劑盒

Yeast DNA Kit

試劑盒內(nèi)容及保存:

試劑盒組成

RTG2409

50次)

貯存方式

緩沖液YL

13 ml

常溫

緩沖液YBL

13 ml

常溫

緩沖液SE

15 ml

常溫

DNA Wash Buffer(濃縮液)

13 ml

常溫

緩沖液WB

30 ml

常溫

洗脫緩沖液EB

15 ml

常溫

蛋白酶K

1 ml

-20℃

Lyticase

1.6 ml

-20℃

RNaseA

0.5 ml

-20℃

Glass Beads

3 g

常溫

吸附柱CG

50個(gè)

常溫

收集管(2 ml)

50個(gè)

常溫

說明書

1份

儲(chǔ)存條件和效期:

室溫保存,12個(gè)月內(nèi)有效。Proteinase K與Lyticase-20℃保存。緩沖液 YBL與緩沖液 YL可能有沉淀產(chǎn)生,37度水浴溶解后即可。

產(chǎn)品簡(jiǎn)介:

酵母DNA提取試劑盒(Yeast DNA Kit)采用了一種新型的硅膠柱。在特定條件下,使DNA能在離心過柱的瞬間,結(jié)合到純化柱上,在一定條件下又能將DNA充分洗脫,從而實(shí)現(xiàn)DNA的快速純化。無(wú)需酚氯仿抽提,無(wú)需酒精沉淀。純化的DNA可直接用于PCR、Southern雜交和酶切等。

準(zhǔn)備工作:

1. 準(zhǔn)備30℃,65℃,70℃水浴;無(wú)水乙醇;制冰機(jī);1.5ml離心管;2ml離心管

2. 按照標(biāo)簽所示在DNA Wash Buffer中加入無(wú)水乙醇,混勻后蓋緊瓶蓋后室溫貯存?zhèn)溆谩?/p>

3. 每次使用前請(qǐng)檢查緩沖液YBL,緩沖液YL是否有沉淀生成,如果出現(xiàn)沉淀,37℃溫浴至沉淀溶解后再使用。

標(biāo)準(zhǔn)操作步驟:

如非指出,所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。

1. 取1-3 ml 酵母培養(yǎng)物(不超過3×107酵母細(xì)胞),12,000 rpm (~13,400×g )離心1分鐘,盡量吸除上清(菌液較多時(shí)可以通過幾次離心將菌體沉淀收集到一個(gè)離心管中)。

注:可用分光光度計(jì)或平板培養(yǎng)法檢測(cè)菌體量,一般對(duì)于釀酒酵母OD600值為1.0時(shí),相當(dāng)于1-2×107cell/ml。

2. 加入480 μl 緩沖液 SE,完全重懸細(xì)胞。加入30μl Lyticase溶液。30℃水浴處理30min。期間振蕩幾次。

注意:以處理時(shí)間為經(jīng)驗(yàn)值,根據(jù)酵母菌株和酵母細(xì)胞數(shù)量的不同,孵育時(shí)間應(yīng)該進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。

3. 4000 rpm(~1500×g)離心10鐘,棄上清,收集沉淀。加入200μl 緩沖液 YL重懸。加入50mg Glass Beads,劇烈渦旋5min。

4. 加入20μl 蛋白酶K,混勻。65℃水浴孵育直至裂解完全,孵育過程中,渦旋幾次。一般來(lái)說1小時(shí)以內(nèi)能徹底裂解。

5. 可選步驟:加入5μl RNaseA并反復(fù)顛倒混勻,在室溫條件下孵育5分鐘。

6. 12,000 rpm (~13,400×g )離心1分鐘,轉(zhuǎn)移上清至新的離心管中。

7. 加入220 μl 緩沖液YBL,振蕩15 秒,70℃放置10 分鐘,溶液應(yīng)變清亮。

注意:加緩沖液YBL 時(shí)可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,一般70℃放置時(shí)會(huì)消失,不會(huì)影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如溶液未變清亮,說明細(xì)胞裂解不徹底,可能導(dǎo)致提取DNA量少和提取出的DNA不純。

8. 加220 μl 無(wú)水乙醇,充分混勻,此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀。

9. 將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30 秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。

10. 向吸附柱中加入500 μl 緩沖液 WB,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30 秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。

11. 向吸附柱 中加入600 μl DNA Wash Buffer(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入無(wú)水乙醇),12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30秒,倒掉廢液,吸附柱放入收集管中。

12. 向吸附柱中加入600 μl DNA Wash Buffer,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。

13. 12,000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。

14. 將吸附柱轉(zhuǎn)入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200 μl 洗脫緩沖液EB或滅菌去離子水,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心1分鐘,將溶液收集到離心管中。

注:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于50 μl,體積過小影響回收效率。洗脫液的pH值對(duì)于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH 值在7.0-8.5 范圍內(nèi)(可以用NaOH將水的pH 值調(diào)到此范圍),pH 值低于7.0 會(huì)降低洗脫效率;

15. DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,以防DNA降解。

DNA濃度及純度檢測(cè):

基因組DNA片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度??膳渲?.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小,完整的基因組大小應(yīng)在23kb以上。使用分光光度計(jì)檢測(cè)時(shí),OD260/OD280比值應(yīng)為1.7–1.9之間,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水洗脫,比值可能偏低,但并不表明DNA純度不高。

常見問題分析:

常見問題

可能原因

建議

堵柱子

樣品量太多,裂解不完全,樣品太粘稠

降低樣品量;

延長(zhǎng)Lyticase酶解時(shí)間;

延長(zhǎng)加入緩沖液YBL和蛋白酶后的裂解放置時(shí)間

低濃度的DNA量

柱子堵塞

見上

DNA殘留在柱子上

增加洗脫液的用量,并在離心洗脫前將洗脫液EB65℃孵育5min。

DNA洗滌不當(dāng)

DNA Wash Buffer按說明書用無(wú)水乙醇稀釋。

下游應(yīng)用不好

提取的DNA含鹽量高

DNA Wash Buffer如果必須按要求用無(wú)水乙醇稀釋,必須室溫放置。

提取的DNA含有乙醇

洗脫前,必須最高轉(zhuǎn)速空甩柱子1min。

酵母基因組DNA提取試劑盒

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