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BioNumerics

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BioNumerics
BioNumerics很好的滿足了研究機(jī)構(gòu)或診斷機(jī)構(gòu)對不同的生物學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的要求。這套軟件系統(tǒng)已經(jīng)得到了很多研究機(jī)構(gòu),包括疾控中心,大學(xué),醫(yī)院,公共醫(yī)療中心,食品,藥物和制藥企業(yè)等各種實驗室的廣泛認(rèn)可。

6大應(yīng)用模塊:

· 指紋圖譜類型:
  處理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, IEF,DGGE, TGGE等電泳數(shù)據(jù);氣相色譜和HPLC數(shù)據(jù);DHPLC數(shù)據(jù); 分光光度曲線等數(shù)據(jù)。
· Character types:
  處理生物抗性實驗數(shù)據(jù);脂肪酸甲基化脂(FAME)分析數(shù)據(jù);生物顯性陣列數(shù)據(jù);API表型測試數(shù)據(jù);微陣列芯片數(shù)據(jù);生化試驗數(shù)據(jù);酶活和代謝活性數(shù)據(jù)等。
· 序列類型:
  處理核酸(DNA或RNA)和氨基酸序列;自動測序儀(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的色譜文件;廣泛的識別各種序列格式, 包括EMBL, GenBank和Fasta格式。
· Trend data types:
  處理實時熒光定量 PCR數(shù)據(jù);代謝活性和酶活性的動力學(xué)數(shù)據(jù);微陣列實驗中的時間進(jìn)程數(shù)據(jù)等和趨勢相關(guān)的實驗數(shù)據(jù)。
· 2D 凝膠類型:
  處理雙向凝膠電泳試驗數(shù)據(jù),DIGE試驗數(shù)據(jù),可將從2-D膠中鑒定到的蛋白點被直接存儲在數(shù)據(jù)庫中。
· 矩陣類型:
  處理DNA同源性相似度的表格數(shù)據(jù);DNA雜交數(shù)據(jù)等矩陣類型數(shù)據(jù)。

7大分析模塊:

· Tree and Network Inference:
  在BioNumerics中通過把關(guān)系數(shù)據(jù)庫中的各種記錄之間,多種試驗之間,用多種有效的聚類算法可以實現(xiàn)多種聚類分析。Bionumerics 6.0 還提供了獨(dú)特的技術(shù)評估聚類分析的可靠性。
· Identification: 根據(jù)生物試驗數(shù)據(jù)結(jié)果來鑒定未知的生物體或物種,可構(gòu)建文庫。
· Molecular Analysis Tools: 開放讀碼框架分析,預(yù)測蛋白序列。限制性酶切分析,引物設(shè)計等。
· Dimensioning techniques: 多維的數(shù)據(jù)存儲,方差分析等生物學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。
· Chromosome Comparison:染色體比對和注釋模塊。
· Database Sharing Tools:數(shù)據(jù)庫共享工具。
· Audit Trailing and Versioning:適用于GLP實驗室

商業(yè)插件:

· Heteroduplex Analysis Plugin
· BandScoring Plugin
· SNP genotyping Plugin
· Diversilab Plugin:與BioMerieux(梅里埃)公司DiversiLab基因分型系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)共享并進(jìn)一步分析


 

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