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教育裝備采購網(wǎng)
第八屆圖書館論壇 校體購2

浪潮高性能計(jì)算助力西安理工大學(xué)水利科學(xué)研究

教育裝備采購網(wǎng) 2012-02-22 15:55 圍觀430次

  教育裝備采購網(wǎng)訊:近日,國內(nèi)高性能計(jì)算創(chuàng)新領(lǐng)導(dǎo)品牌浪潮中標(biāo)西安理工大學(xué)高性能計(jì)算集群項(xiàng)目,將為西安理工大學(xué)水利水電學(xué)院水力學(xué)、河流動(dòng)力學(xué)、環(huán)境流體力學(xué)等方面的科學(xué)研究建設(shè)提供強(qiáng)勁的計(jì)算性能。

  西安理工大學(xué)水利水電學(xué)院是我國西北地區(qū)的水利水電教育科學(xué)研究中心,始建于1937年的西北工學(xué)院,距今已有今七十年的辦學(xué)歷史。學(xué)校在水利水電的科技研究方面一直處于全國的前列,水利工程為國家一級(jí)重點(diǎn)學(xué)科,學(xué)院的科研緊密結(jié)合我國西北地區(qū)的特點(diǎn),特別在旱區(qū)的生態(tài)環(huán)境治理與水資源開發(fā)利用、大中型水利水電工程關(guān)鍵技術(shù)問題的研究等方面取得了豐碩成果。

  此次項(xiàng)目應(yīng)用軟件為以Fluent,F(xiàn)LOW-3D及Delft-3d為主,主要用來模擬泄水建筑物、水庫、河道、湖泊及海洋環(huán)境中水流,波浪,泥沙輸移、污染物歸趨等復(fù)雜流動(dòng)現(xiàn)象。由于水利工程涉及的流動(dòng)區(qū)域大,物理過程演化的時(shí)間尺度長,對(duì)計(jì)算集群的性能提出了很高的要求。為了提升本學(xué)科科學(xué)研究的水平及服務(wù)社會(huì)的能力,西安理工大學(xué)打算打造一個(gè)計(jì)算性能卓越、系統(tǒng)運(yùn)行穩(wěn)定可靠、低功耗、易管理的計(jì)算平臺(tái)。而在具體的系統(tǒng)建設(shè)中,考慮到空間、節(jié)能、系統(tǒng)性能等諸多因素,西安理工大學(xué)組織了多個(gè)HPC專業(yè)供應(yīng)商調(diào)研和測(cè)試。針對(duì)本次應(yīng)用需求,浪潮應(yīng)用資深工程師特別對(duì)硬件配置做了fluent測(cè)試,并得出專業(yè)結(jié)論:Fluent具有較好的CPU Frequency Scalability,性能與主頻提升成正比,當(dāng)運(yùn)行較大規(guī)模算例時(shí),可以運(yùn)行適當(dāng)多的計(jì)算節(jié)點(diǎn)來并行計(jì)算,以達(dá)到更好的加速比。而對(duì)于小規(guī)模算例,數(shù)據(jù)存儲(chǔ)量也相對(duì)較小,用較少節(jié)點(diǎn),每節(jié)點(diǎn)用滿所有CPU核心時(shí),會(huì)取得較好性能。在測(cè)試基礎(chǔ)上,針對(duì)具體的應(yīng)用需求和系統(tǒng)建設(shè)規(guī)劃,浪潮HPC在成熟、先進(jìn)的浪潮TS10000高性能服務(wù)器集群基礎(chǔ)上,做了相關(guān)的系統(tǒng)定制,并從系統(tǒng)建設(shè)、技術(shù)支持與服務(wù)、未來升級(jí)、培訓(xùn)等不同層面提供了真正的解決方案。

  根據(jù)具體應(yīng)用的系統(tǒng)架構(gòu)拓?fù)鋱D如下:

  浪潮針對(duì)此項(xiàng)目的系統(tǒng)建設(shè)特點(diǎn)

  卓越的系統(tǒng)計(jì)算性能;采用業(yè)界最新、最先進(jìn)的異構(gòu)架構(gòu)技術(shù),提升系統(tǒng)運(yùn)行效率;

  瘦計(jì)算節(jié)點(diǎn)采用浪潮NX560T計(jì)算刀片,7U機(jī)箱里支持20個(gè)雙路計(jì)算節(jié)點(diǎn),基于英特爾®至強(qiáng)®5600系列處理器的服務(wù)器可自動(dòng)、智能地實(shí)現(xiàn)性能與功耗平衡,支持服務(wù)器實(shí)時(shí)適應(yīng)應(yīng)用工作負(fù)載和用戶需求,從而提供最佳性能。這也有助于系統(tǒng)的節(jié)能降耗和節(jié)省機(jī)房空間。

  胖計(jì)算節(jié)點(diǎn)選用浪潮NF8560M2服務(wù)器:該服務(wù)器采用最新的QPI高速互聯(lián)技術(shù),支持達(dá)40計(jì)算核心80計(jì)算線程120MB高速緩存的INTEL NEHALEM-EX XEON多路多核處理器,系統(tǒng)聯(lián)機(jī)事務(wù)綜合處理性能提升3倍以上,數(shù)據(jù)庫性能提升3.3倍以上,虛擬化性能提升4倍以上,滿足水利水電專業(yè)應(yīng)用軟件對(duì)系統(tǒng)計(jì)算性能需求;

  采用CPU+GPU協(xié)同加速結(jié)構(gòu),1U空間內(nèi)實(shí)現(xiàn)2萬億次/秒的計(jì)算能力。作為應(yīng)用軟件專項(xiàng)應(yīng)用的補(bǔ)充,同時(shí)為將來新的應(yīng)用軟件平臺(tái)開發(fā)和移植提供絕佳平臺(tái)。

  采用浪潮NF5280M2作為終端工作站,通過Raid 5數(shù)據(jù)保護(hù);

  對(duì)于所有節(jié)點(diǎn)均配置1+1冗余服務(wù)器專用低功耗節(jié)能電源,極大提高系統(tǒng)工作的可靠性。

  業(yè)界先進(jìn)的計(jì)算網(wǎng)絡(luò)

  采用infiniband QDR網(wǎng)絡(luò),連接所有計(jì)算節(jié)點(diǎn)、IO節(jié)點(diǎn)、組成全線速40Gbps無阻塞網(wǎng)絡(luò)??梢猿浞掷糜?jì)算資源,最大限度發(fā)揮系統(tǒng)的效能。較高的通信帶寬和較低的通信延遲,能夠更好的保證應(yīng)用算法對(duì)并行計(jì)算效率的要求,提高加速比。

  卓越的數(shù)據(jù)IO與存儲(chǔ)系統(tǒng)

  雙路IO節(jié)點(diǎn)選用浪潮NF5220雙路服務(wù)器,采用一體化存儲(chǔ)擴(kuò)展模塊,使用戶可以隨時(shí)添加外接存儲(chǔ)組件,不需添加任何成本,靈活、可靠;

  存儲(chǔ)系統(tǒng)采用浪潮AS400G2 8Gbps光纖產(chǎn)品,配置8Gb光纖主機(jī)通道,提供海量存儲(chǔ)容量,為當(dāng)前和未來的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)提供充足空間,有效保護(hù)現(xiàn)有投資。

  軟件:浪潮提供系統(tǒng)的應(yīng)用工作組件:

  Redhat linux 企業(yè)級(jí)操作系統(tǒng)5.5;

  浪潮TSMM集群監(jiān)控管理軟件,實(shí)現(xiàn)對(duì)整套系統(tǒng)的單一映射,從而為系統(tǒng)管理員提供監(jiān)控管理集群中各個(gè)節(jié)點(diǎn)的統(tǒng)一平臺(tái);

  浪潮TSJM作業(yè)管理軟件,實(shí)現(xiàn)多用戶多作業(yè)的策略調(diào)度,提升資源利用率與管理效率;

  浪潮TSDM集群部署軟件、浪潮睿捷集群備份軟件。

  浪潮HPC應(yīng)用方案具有計(jì)算性能卓越、系統(tǒng)運(yùn)行穩(wěn)定可靠、功耗控制領(lǐng)先、監(jiān)控管理系統(tǒng)方便易用、系統(tǒng)開放易于擴(kuò)展、保護(hù)建設(shè)投資等特點(diǎn)。作為領(lǐng)先的高性能計(jì)算產(chǎn)品與應(yīng)用創(chuàng)新領(lǐng)導(dǎo)廠商,浪潮一貫提倡深度挖掘行業(yè)應(yīng)用,提出HPC系統(tǒng)不僅要“好用”,更要“用好”的理念,在清華大學(xué)、吉林大學(xué)、西安交通大學(xué)、山東大學(xué)、華中科技大學(xué)、安徽大學(xué)、中國海洋大學(xué)、山東超算中心等先后建設(shè)了從數(shù)十萬億次到千萬億次的超級(jí)計(jì)算機(jī)平臺(tái),具有豐富的超算系統(tǒng)建設(shè)運(yùn)維經(jīng)驗(yàn)。據(jù)慧聰鄧白氏調(diào)研報(bào)告顯示,2010年浪潮在高校高性能計(jì)算市場(chǎng)占有率第一。

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