培訓(xùn)時(shí)間：2017年12月7-8日(周四至周五)
培訓(xùn)地點(diǎn)：蘇州創(chuàng)騰科技培訓(xùn)中心(江蘇省蘇州市工業(yè)園區(qū)東長路88號2.5產(chǎn)業(yè)園A2棟301室)
?培訓(xùn)主旨：
抗體藥物作為生物藥物的主力軍，以其高特異性、有效性和安全性正在發(fā)展成為國際藥品市場上一大類新型診斷和治療藥物，日益成為許多重要疾病(癌癥、慢性炎癥疾病、心血管疾病、免疫系統(tǒng)疾病等)治療市場的新寵。而分子模擬技術(shù)在近20年內(nèi)已兩次榮登諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的獎(jiǎng)臺(tái)，成為生命科學(xué)領(lǐng)域認(rèn)識和解決復(fù)雜的科學(xué)和工程問題的重要方法。借助分子模擬技術(shù)進(jìn)行抗體藥的理性設(shè)計(jì)已成為未來治療性抗體研發(fā)新趨勢，其重要作用也越來越多的得到體現(xiàn)。Discovery Studio作為面向生命科學(xué)領(lǐng)域的分子模擬與分子設(shè)計(jì)軟件，不僅可以為抗體研發(fā)者們提供一個(gè)易于操作使用的抗體建模環(huán)境，而且還可以以抗體結(jié)構(gòu)作為起點(diǎn)，優(yōu)化抗體作為治療性藥物的療效和藥物可發(fā)展性，從而助力抗體新藥研發(fā)，提高抗體成藥性，加速抗體研發(fā)周期，降低研發(fā)成本。本次培訓(xùn)班旨在幫助學(xué)員系統(tǒng)了解、掌握如何應(yīng)用Discovery Studio進(jìn)行抗體理性設(shè)計(jì)并快速上機(jī)操作。
?培訓(xùn)對象：
從事抗體藥物研發(fā)相關(guān)領(lǐng)域的科研工作者，以及有興趣想要借助Discovery Studio分子模擬平臺(tái)來開展抗體理性設(shè)計(jì)工作并能快速上機(jī)模擬操作的相關(guān)人員。
?培訓(xùn)內(nèi)容：
本次培訓(xùn)主要以Discovery Studio軟件為依托，詳細(xì)介紹DS在抗體理性設(shè)計(jì)領(lǐng)域提供的一系列完美解決方案與上機(jī)操作，內(nèi)容包括：
- 抗體序列的注釋：抗體重鏈及輕鏈可變區(qū)、恒定區(qū)、CDR區(qū)的注釋，抗體Gemline基因的識別;
- 抗體序列的分析：抗體翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(如糖基化位點(diǎn)等)，抗原線性表位預(yù)測;
- 抗體結(jié)構(gòu)的預(yù)測與優(yōu)化，全長抗體、抗體Fab區(qū)、scFv結(jié)構(gòu)的預(yù)測，抗體人源化改造;
- 抗體-抗原相互作用的預(yù)測，抗原構(gòu)象表位的識別;
- 抗體分子的設(shè)計(jì)與改造：抗體親和力成熟，抗體穩(wěn)定性優(yōu)化，雙特異性抗體設(shè)計(jì)，抗體聚集效應(yīng)分析。
?培訓(xùn)形式：
1、通過文獻(xiàn)案例分析講解抗體理性設(shè)計(jì)策略，以及相應(yīng)功能模塊的原理介紹;
2、上機(jī)操作：講解抗體理性設(shè)計(jì)過程中每一步驟的具體操作流程及參數(shù)設(shè)置(提供完整的培訓(xùn)教程);
3、學(xué)員交流與討論，工程師進(jìn)行現(xiàn)場答疑答疑。
?課程安排：
第一天
08:30-09:00
報(bào)到和注冊
報(bào)到地點(diǎn)：蘇州創(chuàng)騰培訓(xùn)中心
09:00-10:30
Discovery Studio基本界面
DS背景介紹，DS界面介紹，DS入門操作，
抗體、抗原分子的預(yù)處理方法介紹與實(shí)際操作。
10:30-10:45
茶歇
10:45-11:45
抗體理性設(shè)計(jì)概述
抗體理性設(shè)計(jì)專題之一：抗體序列的分析
基于抗體序列注釋抗體結(jié)構(gòu)域和CDR loop區(qū)，識別Gemline基因，預(yù)測PTM翻譯后修飾位點(diǎn)、抗原線性表位。
11:45-13:30
午餐
13:30-15:00
抗體理性設(shè)計(jì)專題之二：抗體結(jié)構(gòu)的預(yù)測及優(yōu)化、抗體人源化
抗體Fab區(qū)、Fv區(qū)、scFv、全長結(jié)構(gòu)及雙特異性抗體結(jié)構(gòu)的構(gòu)建，CDR區(qū)的優(yōu)化，抗體人源化改造策略，基本原理介紹及案例分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗體理性設(shè)計(jì)專題之二：抗體結(jié)構(gòu)的構(gòu)建及優(yōu)化、抗體人源化
抗體建模參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
16:30-17:15
課程討論及答疑
第二天
09:00-10:15
抗體理性設(shè)計(jì)專題之三：抗體-抗原相互作用預(yù)測(CDOCKER)
抗體、抗原結(jié)合模式的確定，結(jié)合表面關(guān)鍵殘基的分析，抗原表位的識別。
基本原理介紹及案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
10:15-10:30
茶歇
10:30-11:45
抗體理性設(shè)計(jì)專題之三：抗體-抗原相互作用預(yù)測(ZDOCK)
抗體、抗原結(jié)合模式的確定，結(jié)合表面關(guān)鍵殘基的分析，抗原表位的識別。
基本原理介紹及案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
11:45-13:30
午餐
13:30-14:15
抗體理性設(shè)計(jì)專題之四：抗體親和力成熟(虛擬氨基酸突變掃描)
虛擬氨基酸掃描突變，識別能夠優(yōu)化抗體結(jié)合親和力的突變位點(diǎn)，pH和溫度等環(huán)境因素的考慮。
基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
14:15-15:00
抗體理性設(shè)計(jì)專題之五：抗體穩(wěn)定性優(yōu)化(虛擬氨基酸突變掃描)
虛擬氨基酸掃描突變，搜索能夠穩(wěn)定抗體結(jié)構(gòu)的突變位點(diǎn)，抗體人源化過程中影響穩(wěn)定性的back mutation位點(diǎn)的分析。
基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗體理性設(shè)計(jì)專題之六：抗體穩(wěn)定性優(yōu)化(抗體聚集效應(yīng)的預(yù)測)
識別抗體結(jié)構(gòu)中易于聚集的位點(diǎn)以進(jìn)行突變優(yōu)化，以抗體聚集效應(yīng)作為指標(biāo)評價(jià)抗體的穩(wěn)定性和可發(fā)展性以篩選在研抗體。
基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。
16:30-17:15
課程討論及答疑
