培訓(xùn)時(shí)間：2017年12月7-8日（周四至周五）
培訓(xùn)地點(diǎn)：蘇州創(chuàng)騰科技培訓(xùn)中心（江蘇省蘇州市工業(yè)園區(qū)東長(zhǎng)路88號(hào)2.5產(chǎn)業(yè)園A2棟301室）
?培訓(xùn)主旨：
抗體藥物作為生物藥物的主力軍，以其高特異性、有效性和安全性正在發(fā)展成為國(guó)際藥品市場(chǎng)上一大類新型診斷和治療藥物，日益成為許多重要疾?。ò┌Y、慢性炎癥疾病、心血管疾病、免疫系統(tǒng)疾病等）治療市場(chǎng)的新寵。而分子模擬技術(shù)在近20年內(nèi)已兩次榮登諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的獎(jiǎng)臺(tái)，成為生命科學(xué)領(lǐng)域認(rèn)識(shí)和解決復(fù)雜的科學(xué)和工程問(wèn)題的重要方法。借助分子模擬技術(shù)進(jìn)行抗體藥的理性設(shè)計(jì)已成為未來(lái)治療性抗體研發(fā)新趨勢(shì)，其重要作用也越來(lái)越多的得到體現(xiàn)。Discovery Studio作為面向生命科學(xué)領(lǐng)域的分子模擬與分子設(shè)計(jì)軟件，不僅可以為抗體研發(fā)者們提供一個(gè)易于操作使用的抗體建模環(huán)境，而且還可以以抗體結(jié)構(gòu)作為起點(diǎn)，優(yōu)化抗體作為治療性藥物的療效和藥物可發(fā)展性，從而助力抗體新藥研發(fā)，提高抗體成藥性，加速抗體研發(fā)周期，降低研發(fā)成本。本次培訓(xùn)班旨在幫助學(xué)員系統(tǒng)了解、掌握如何應(yīng)用Discovery Studio進(jìn)行抗體理性設(shè)計(jì)并快速上機(jī)操作。
?培訓(xùn)對(duì)象：
從事抗體藥物研發(fā)相關(guān)領(lǐng)域的科研工作者，以及有興趣想要借助Discovery Studio分子模擬平臺(tái)來(lái)開(kāi)展抗體理性設(shè)計(jì)工作并能快速上機(jī)模擬操作的相關(guān)人員。
?培訓(xùn)內(nèi)容：
本次培訓(xùn)主要以Discovery Studio軟件為依托，詳細(xì)介紹DS在抗體理性設(shè)計(jì)領(lǐng)域提供的一系列完美解決方案與上機(jī)操作，內(nèi)容包括：
- 抗體序列的注釋：抗體重鏈及輕鏈可變區(qū)、恒定區(qū)、CDR區(qū)的注釋，抗體Gemline基因的識(shí)別；
- 抗體序列的分析：抗體翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè)（如糖基化位點(diǎn)等），抗原線性表位預(yù)測(cè)；
- 抗體結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)與優(yōu)化，全長(zhǎng)抗體、抗體Fab區(qū)、scFv結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)，抗體人源化改造；
- 抗體-抗原相互作用的預(yù)測(cè)，抗原構(gòu)象表位的識(shí)別；
- 抗體分子的設(shè)計(jì)與改造：抗體親和力成熟，抗體穩(wěn)定性優(yōu)化，雙特異性抗體設(shè)計(jì)，抗體聚集效應(yīng)分析。
?培訓(xùn)形式：
1、通過(guò)文獻(xiàn)案例分析講解抗體理性設(shè)計(jì)策略，以及相應(yīng)功能模塊的原理介紹；
2、上機(jī)操作：講解抗體理性設(shè)計(jì)過(guò)程中每一步驟的具體操作流程及參數(shù)設(shè)置（提供完整的培訓(xùn)教程）；
3、學(xué)員交流與討論，工程師進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)答疑答疑。
?課程安排：
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日期 |
時(shí)間 |
內(nèi)容 |
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第一天
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08:30-09:00 |
報(bào)到和注冊(cè) |
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09:00-10:30 |
Discovery Studio基本界面 DS背景介紹，DS界面介紹，DS入門操作， 抗體、抗原分子的預(yù)處理方法介紹與實(shí)際操作。 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-11:45 |
抗體理性設(shè)計(jì)概述 抗體理性設(shè)計(jì)專題之一：抗體序列的分析 基于抗體序列注釋抗體結(jié)構(gòu)域和CDR loop區(qū)，識(shí)別Gemline基因，預(yù)測(cè)PTM翻譯后修飾位點(diǎn)、抗原線性表位。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之二：抗體結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)及優(yōu)化、抗體人源化 抗體Fab區(qū)、Fv區(qū)、scFv、全長(zhǎng)結(jié)構(gòu)及雙特異性抗體結(jié)構(gòu)的構(gòu)建，CDR區(qū)的優(yōu)化，抗體人源化改造策略，基本原理介紹及案例分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之二：抗體結(jié)構(gòu)的構(gòu)建及優(yōu)化、抗體人源化 抗體建模參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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16:30-17:15 |
課程討論及答疑 |
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第二天 |
09:00-10:15 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之三：抗體-抗原相互作用預(yù)測(cè)（CDOCKER） 抗體、抗原結(jié)合模式的確定，結(jié)合表面關(guān)鍵殘基的分析，抗原表位的識(shí)別。 基本原理介紹及案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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10:15-10:30 |
茶歇 |
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10:30-11:45 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之三：抗體-抗原相互作用預(yù)測(cè)（ZDOCK） 抗體、抗原結(jié)合模式的確定，結(jié)合表面關(guān)鍵殘基的分析，抗原表位的識(shí)別。 基本原理介紹及案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-14:15 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之四：抗體親和力成熟（虛擬氨基酸突變掃描） 虛擬氨基酸掃描突變，識(shí)別能夠優(yōu)化抗體結(jié)合親和力的突變位點(diǎn)，pH和溫度等環(huán)境因素的考慮。 基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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14:15-15:00 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之五：抗體穩(wěn)定性優(yōu)化（虛擬氨基酸突變掃描） 虛擬氨基酸掃描突變，搜索能夠穩(wěn)定抗體結(jié)構(gòu)的突變位點(diǎn)，抗體人源化過(guò)程中影響穩(wěn)定性的back mutation位點(diǎn)的分析。 基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
抗體理性設(shè)計(jì)專題之六：抗體穩(wěn)定性優(yōu)化（抗體聚集效應(yīng)的預(yù)測(cè)） 識(shí)別抗體結(jié)構(gòu)中易于聚集的位點(diǎn)以進(jìn)行突變優(yōu)化，以抗體聚集效應(yīng)作為指標(biāo)評(píng)價(jià)抗體的穩(wěn)定性和可發(fā)展性以篩選在研抗體。 基本原理介紹、案例分析、參數(shù)設(shè)置、實(shí)際操作技巧及結(jié)果分析。 |
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16:30-17:15 |
課程討論及答疑 |
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