基因合成是指在體外人工合成雙鏈DNA分子的技術(shù)，與寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是單鏈的，所能合成的最長片段僅為100nt左右，而基因合成則為雙鏈DNA分子合成，所能合成的長度范圍50bp-12 kb?；蚝铣墒怯萌斯し椒ê铣苫虻募夹g(shù)，是基因獲取的手段之一，相對于從已有生物中獲取基因來說，基因合成無需模板，因而不受基因來源限制。
人類首條人工合成的基因出現(xiàn)在上世紀60年代，基因合成是當前合成生物學的主要內(nèi)容，通過基因合成，可以獲得自然界中不存在的基因，為人類改造生物開辟了一個全新的方向，在可預計的將來，基因合成將在生命科學領(lǐng)域發(fā)揮巨大作用，在新能源、新材料、人工生命、核酸疫苗、生物醫(yī)藥等領(lǐng)域的作用已初步體現(xiàn)?；蚝铣梢泊嬖跐撛诘谋婚_發(fā)成生物武器的可能，而這個可能性在幾個病毒的人工合成之后變得更加突出。
基因合成有兩種途徑，一是向基因合成公司訂制，二是作本地基因合成。由于基因合成技術(shù)還沒有一個統(tǒng)一的方法，基因合成的技能和經(jīng)驗在合成過程中具有決定性的影響，所以大部分基因合成都是在專業(yè)人員手中完成的，這也決定了途徑一是主要渠道。
本地基因合成一般需要參考學術(shù)文章，這方面的文章有很多。但大多只是個別基因的合成，只具備有限的參考價值，除非是那些為了研究技術(shù)本身而作的基因合成。對于需要作本地基因合成的實驗者來說，使用"基因合成試劑盒"也許是一個好的選擇。
基因合成的優(yōu)點：一:合成周期短，可以保證序列的100%正確無誤；二:基因合成具有更大的靈活性，可以對基因的酶切位點和基因序列進行修改，方便下游的克隆和實驗；三:研究人員根據(jù)自己的意愿設計得到自然界中很難獲得甚至不存在的基因；四:基因合成的基因可以進行密碼子優(yōu)化，使基因在各種生物表達體系中都能得到良好表達。
基因合成的應用：一:克隆人鼠抗體或重組抗體；二:合成不同的基因突變株、SNPS、或其它突變株；三:設計合成DNA疫苗；四:大量合成用于微芯片的cDNA。
