5月21日，國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《Cell》雜志在線發(fā)表題為“A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases”的研究論文，該論文由大連醫(yī)科大學(xué)馬驍馳教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所以及法國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院合作完成。
該研究通過(guò)人類腸道真菌的大規(guī)模培養(yǎng)測(cè)序，建立了迄今為止最大的人類培養(yǎng)腸道真菌參考基因組目錄（760個(gè)腸道真菌基因組，涵蓋48科、206種），并完成真菌分離株的代謝功能解析，揭示人類腸道真菌多樣性及其在常見(jiàn)疾病中的潛在作用，顯著擴(kuò)展現(xiàn)有腸道真菌基因組資源，為腸道真菌群落結(jié)構(gòu)、生物功能等方面研究提供重要參考數(shù)據(jù)。
真菌群落作為人體消化系統(tǒng)中腸道微生態(tài)的組成部分之一，對(duì)宿主的各種生理、病理過(guò)程產(chǎn)生影響。由于腸道真菌參考基因組的數(shù)量有限，導(dǎo)致人們對(duì)人類腸道真菌在群落結(jié)構(gòu)、遺傳、生物功能方面的認(rèn)知不夠清晰。該研究通過(guò)所構(gòu)建的培養(yǎng)組技術(shù)，從135名健康中國(guó)人糞便樣本中培養(yǎng)出12453株真菌，并進(jìn)行全基因組測(cè)序，生成了迄今為止最大的人體腸道真菌菌株庫(kù)。通過(guò)二代測(cè)序獲得了760個(gè)真菌的基因組，包括來(lái)自48個(gè)科的206個(gè)物種，其中69種為未見(jiàn)報(bào)道的新種。進(jìn)一步整合靶向代謝組與基因組，系統(tǒng)分析并比較了真菌物種的代謝活力和代謝類型，指出不同物種之間的代謝屬性差異與特征。此外，基于真菌基因組數(shù)據(jù)集以及11000個(gè)公開(kāi)的糞便宏基因組數(shù)據(jù)，該研究對(duì)人體腸道真菌物種的流行度、豐度差異性進(jìn)行分析，明確高豐度真菌和廣泛流行的真菌物種。更為重要的是，該研究基于大規(guī)模的真菌基因組目錄分析28個(gè)疾病的腸道真菌組特征，揭示疾病相關(guān)的腸道真菌特征信號(hào)，并聚焦炎性腸病患者的腸道真菌特征，在多種小鼠結(jié)腸炎模型中驗(yàn)證了特征菌株的生物功能，闡明了部分活性物質(zhì)和分子機(jī)制。
綜上，該研究構(gòu)建的真菌基因組目錄以及功能解析拓展了人們對(duì)人體腸道菌群的生物多樣性和疾病相關(guān)性的理解，為腸道菌相關(guān)疾病的診療提供新思路。
大連醫(yī)科大學(xué)為該研究的牽頭完成單位；大連醫(yī)科大學(xué)鄢秋龍副教授、霍曉奎副教授、碩士研究生閆青松以及中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)李勝輝研究員為該論文并列第一作者；大連醫(yī)科大學(xué)馬驍馳教授、王超教授、上海藥物研究所果德安教授以及法國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院Francis Martin教授為該論文共同通訊作者。
近年來(lái)，學(xué)校充分發(fā)揮“交叉科研合作課題組”科研攻關(guān)作用，推動(dòng)基礎(chǔ)與臨床、醫(yī)工醫(yī)理等交叉學(xué)科科研合作，推進(jìn)重大科技基礎(chǔ)設(shè)施布局建設(shè)，不斷提升科技創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化能力；以加強(qiáng)青年科技人才隊(duì)伍建設(shè)為抓手，遵循人才成長(zhǎng)規(guī)律，科學(xué)制定青年科技人才培養(yǎng)計(jì)劃，建立完善青年科技人才評(píng)價(jià)機(jī)制；持續(xù)推進(jìn)學(xué)校青年項(xiàng)目培育基金建設(shè)，加大對(duì)青年科技人才的普惠支持力度，特別支持40周歲以下青年教師和女性教師，充分激發(fā)了青年科技人才創(chuàng)新活動(dòng)與動(dòng)力。
未來(lái)，學(xué)校將堅(jiān)持面向國(guó)際科技前沿和國(guó)家重大戰(zhàn)略需求，瞄準(zhǔn)遼寧全面振興新突破需要，把握難得機(jī)遇，突出發(fā)展重點(diǎn)，充分發(fā)揮特色優(yōu)勢(shì)學(xué)科、專業(yè)、學(xué)位點(diǎn)的引領(lǐng)輻射作用，加強(qiáng)主干學(xué)科與支撐學(xué)科交叉融合，加大對(duì)青年科技人才的支持培養(yǎng)力度，努力培養(yǎng)造就更多科技領(lǐng)軍人才和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，有組織地提升交叉科研能力，完善優(yōu)勢(shì)與特色、傳統(tǒng)與新興、應(yīng)用與基礎(chǔ)、綜合與交叉相促進(jìn)的總體布局，在未來(lái)新興領(lǐng)域進(jìn)一步凸顯大醫(yī)新質(zhì)生產(chǎn)力，為加快實(shí)現(xiàn)高水平科技自立自強(qiáng)塑造新動(dòng)能新優(yōu)勢(shì)。
全文鏈接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00469-0
