1.選用優(yōu)質(zhì)的瓊脂糖：不同品牌的瓊脂糖在質(zhì)量上有較大的差異。劣質(zhì)瓊脂糖會導致DNA條帶模糊，甚至條帶缺失。因此請盡量選擇質(zhì)量穩(wěn)定可靠的品牌。
2.選擇適當?shù)哪z濃度：
瓊脂糖凝膠的線性DNA分辨范圍
3.凝膠制備：配制凝膠和電泳應選用相同的1x緩沖液;使用的容器體積至少是凝膠溶液的3倍，以免溶液沸騰時溢出;制膠過程中盡量趕除氣泡;根據(jù)樣品的濃度和體積選擇適當大小的梳子。
4.選擇適當?shù)碾娪揪彌_液：GenStar® SD緩沖液(Cat. No. E101-50)和TBE緩沖液適用于分離比較小的DNA片段，TAE緩沖液(Cat. No. E102-50)適用于分離比較大的DNA片段;緩沖液應及時更新;膠回收純化應使用新鮮配制的1x電泳緩沖液，以防核酸酶和DNA雜帶污染。
5.核酸樣品的準備：提取的DNA樣品應去除蛋白和多余的鹽分等雜質(zhì);PCR樣品應盡量在24小時內(nèi)電泳檢測，否則條帶容易模糊。
6.上樣緩沖液：所有泳道應使用相同的上樣緩沖液，以防止因離子強度不同造成條帶遷移率偏差。
7.適量上樣：上樣過多會導致上樣孔超載，出現(xiàn)拖帶現(xiàn)象;上樣體積過小可能導致條帶亮度不均。
8.電壓及電泳時間：根據(jù)電泳槽型號、凝膠濃度、電泳緩沖液種類和目的條帶大小等選擇適當?shù)碾妷汉碗娪緯r間。使用GenStar®SD電泳緩沖液時，電壓設置為20~35 v/cm膠長;使用TAE或TBE緩沖液時，最大電壓以不超過20 v/cm膠長為宜。
